Antes de la llegada de los conquistadores, el Valle del hoy municipio de Ebéjico estaba poblado por las tribus aborígenesEbéjicos y Peques, ambos grupos de la familia de los Nutabes.
En 1595, don Gaspar de Rodas, tras vencer a los naturales, procedió a adjudicar las tierras de Ebéjico a los vencedores, y a encomendar los indígenas al capitán Manuel López Bravo. Ya en 1830, el caserío llevaba el original nombre de “La Comunidad”.
En 1833, por orden del gobernador Juan de Dios Aranzazu, se creó la parroquia con el nombre de Ebéjico, dado que el territorio fue habitado por la indómita tribu del mismo nombre. El gobernador Aranzazu erigió en distrito municipal a la Comunidad del Valle de Miraflores y la señaló como asiento del nuevo poblado (hoy Ebéjico).